Kolonoskopi, bağırsak sağlığını tehdit eden çeşitli rahatsızlıkların tespiti ve tedavisi için yapılır. Sağlık uzmanları tarafından önerilen kolonoskopi işlemi, aşağıdaki durumlarda gerekli görülür:

• 45 yaşından itibaren kolon kanseri veya poliplerin erken tespiti için düzenli tarama yapılması
• Ailede kolon kanseri öyküsü veya genetik yatkınlık bulunması durumunda daha erken ve sık tarama yapılması
• Rektal kanama nedeninin tespiti
• Bağırsak alışkanlıklarında fark edilen kalıcı değişikliklerin nedeninin tespiti
• Açıklanamayan karın ağrısı veya kilo kaybı kaynağının saptanması
• Dışkıda gizli kan testinin pozitif çıkması
• Görüntüleme çalışmalarında şüpheli bulgular saptanması
• Crohn hastalığı veya ülseratif kolit gibi inflamatuar bağırsak hastalıklarının izlenmesi
• Polip çıkarımı sonrası tekrarların önlenmesi

İşlem öncesinde kolonoskopi öncesi beslenme kurallarına dikkat edilmesi ve bağırsak temizliğinin tam olarak yapılması, işlemin başarısı için büyük önem taşır.