Kolonoskopi işlemi genellikle 20-40 dakika sürer. Ancak, bağırsakta polip alınması veya biyopsi yapılması gibi ek işlemler süreyi uzatabilir.
İşlem sonrasında hasta, anestezinin etkilerinin geçmesi için yaklaşık 1-2 saat dinlenir. Sonrasında genellikle aynı gün taburcu edilir ve normal yaşantısına dönebilir. Ancak, sedasyon uygulandığı için işlem sonrası gün boyunca araç kullanılmaması ve dinlenilmesi önerilir.
